2009年12月11日，根據《國家自然科學基金條例》、《國家自然科學基金依托單位注冊管理暫行辦法》和《關于受理2009年度國家自然科學基金依托單位注冊申請的通知》等文件規定及要求，經審核批準，故宮博物院正式成為國家自然科學基金依托單位。
　　國家自然科學基金是我國支持基礎研究的主渠道之一，面向全國，重點資助具有良好研究條件、研究實力的高等院校中和科研機構中的研究人員。在2006年發布的國家自然科學基金“十一五”發展規劃中，提出“支持基礎研究、堅持自由探索、發揮導向作用”的戰略定位，貫徹“尊重科學、發揚民主、提倡競爭、促進合作、激勵創新、引領未來”的工作方針。此次故宮博物院被成功批準注冊為國家自然科學基金依托單位，標志著院科學技術基礎研究進入了一個更廣闊、更深入和更全面的階段。